În biologia moleculară, STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) este o bază de date biologică și o resursă web a interacțiunilor proteine-proteine cunoscute și prezise. … Cea mai recentă versiune 11b conține informații despre aproximativ 24, 5 milioane de proteine din peste 5000 de organisme.
Care este scopul bazei de date STRING?
Baza de date STRING urmărește să colecteze și să integreze aceste informații, prin consolidarea proteinelor cunoscute și prezise–date de asociere de proteine pentru un număr mare de organisme.
Ce este un scor STRING?
În STRING, fiecare interacțiune proteină-proteină este adnotată cu unul sau mai multe „scoruri”. Important este că aceste scoruri nu indică puterea sau specificul interacțiunii. În schimb, sunt indicatori ai încrederii, adică cât de probabil STRING consideră că o interacțiune este adevărată, având în vedere dovezile disponibile.
De ce interacționează proteinele?
Interacțiunile proteină-proteină (IPP) sunt contacte fizice de în altă specificitate stabilite între două sau mai multe molecule de proteine ca urmare a unor evenimente biochimice conduse de interacțiuni care includ forțe electrostatice, hidrogen lipirea și efectul hidrofob.
Ce este asocierea funcțională?
definiție. Relație binară între entitățile biologice atunci când una dintre ele o modulează pe ceal altă în ceea ce privește funcția, expresia, degradarea sau stabilitatea celeil alte și relațiaîntre parteneri nu pot fi stabiliți ca directe, așa că pașii intermediari sunt implicit prezenți.