Arabinoza este un zahăr cu cinci atomi de carbon care se găsește pe scară largă în natură și poate servi ca sursă unică de carbon în multe bacterii. Produsele proteice din trei gene (araB, araA și araD) sunt necesare pentru degradarea arabinozei la membrii familiei Enterobacteriaceae, cum ar fi E. coli și S.
Ce face arabinoza bacteriilor?
Astfel, atunci când arabinoză este prezentă pentru a porni operonul arabinoză, GFP este produsă, iar bacteriile pot fluoresce. Fără arabinoză, gena GFP nu este exprimată și nu există fluorescență. Deci, prin variarea compoziției nutrienților, un cercetător poate controla când (și dacă) apare înflorirea în bacteriile transformate.
Care este rolul arabinozei în transformarea bacteriană?
Arabinoza acționează ca un regulator alosteric al AraC, schimbând la ce site-uri ADN se leagă și modul în care formează un dimer. Amintiți-vă că arabinoza este zahărul care este catabolizat de proteinele operonului AraBAD. Când se adaugă arabinoză în mediul în care trăiește E. coli, se leagă strâns de AraC.
De ce se folosește arabinoza?
Utilizare în biologie
În biologia sintetică, arabinoza este adesea folosită ca un comutator unidirecțional sau reversibil pentru exprimarea proteinelor sub Pbadpromotor în E. coli. Această pornire poate fi anulată prin prezența glucozei sau inversată prin adăugarea de glucoză în mediul de cultură, care este o formă de reprimare a cataboliților.
Cumarabinoza afectează reglarea și expresia genelor în bacterii?
Când este prezentă arabinoza, araC relaxează configurația ADN-ului, astfel încât transcripția să poată avea loc, dar când acest carbohidrat este absent, aceeași proteină constrânge ADN-ul pentru a-și reduce capacitatea de a se lega cu ARN polimerază.